L'amélioration du bien-être animal (BEA) est un élément clé de la durabilité des systèmes de production animale. La transition agroécologique (AE) de ces systèmes aura des impacts majeurs sur le BEA, avec des effets positifs attendus (augmentation de l'espace alloué aux animaux, plus de liberté d’expression de leurs comportements naturels), mais aussi des vulnérabilités spécifiques (régimes alimentaires moins optimisés et plus diversifiés, environnement fluctuant, émergence d'agents pathogènes).