L'adaptation des bactéries aux changements environnementaux nécessite une réorganisation rapide de l’expression du génome. Cette réponse adaptative est médiée par des facteurs de transcription spécifiques, la topologie de l'ADN et des régulateurs globaux représentés par les protéines associées aux nucléoïdes (NAPs), qui contraignent le sur-enroulement de l’ADN et modulent la structure de la chromatine et la transcription de nombreux gènes.