1. AMPERE
(Génie Electrique, Electromagnétisme, Automatique, Microbiologie Environnementale et Applications) CNRS UMR 5005 avec ECL et LYON1
(Directeur par interim : Guy Clerc)

2. Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions
(BF2I) INRA UMR 203 (Directeur : Abdelaziz HEDDI)

3. Centre d'Innovation en Télécommunications et Intégration de services
(CITI) EA3720 (Directeur : Jean-Marie GORCE)

4. Centre de Recherche en Acquisition et Traitement d'Images pour la Santé
(CREATIS) CNRS UMR 5220 avec LYON1, HCL, Centre Léon Bérard et INSERM (Directrice : Isabelle MAGNIN)

5. Centre de Thermique de Lyon
(CETHIL) CNRS UMR 5008 avec LYON1 (Directeur : Jocelyn BONJOUR)

6. Environnement, Ville, Société
(EVS) CNRS UMR 5600 avec LYON3, LYON2, ENS SHS, ENTPE et CRENAM (Directeur : Jean-Yves TOUSSAINT)
Site INSA : ITUS (Responsable : Jean-Michel Deleuil)

7.  Laboratoire de Génie Civil et d'Ingénierie Environnementale
(LGCIE) EA 4126 avec LYON1 (Directeur : Ali LIMAM)

8. Laboratoire de Génie Électrique et Ferroélectricité
(LGEF) EA 682 (Directeur : Daniel GUYOMAR)

9. Laboratoire d'Informatique en Images et Systèmes d'Information
(LIRIS) CNRS UMR5205 avec LYON1, LYON2 et ECL (Directeur : Atilla BASKURT - Directeur Adjoint : Jean-François BOULICAUT)

10. Institut Camille Jordan
(ICJ) CNRS UMR 5208 avec LYON1 et ECL (Responsable site INSA : Jérôme POUSIN)

11. Institut de Chimie et de Biochimie Moléculaires et Supramoléculaires
(ICBMS) CNRS UMR 5246 avec LYON1, CPE (Directeur Site INSA : Yves Queneau)

12. Institut des Nanotechnologies de Lyon
(INL) CNRS UMR 5270 avec LYON1, CPE et ECL (Directrice : Catherine BRU-CHEVALLIER)

13. Décision et Information pour les Systèmes de Production
(DISP) EA 4570 avec LYON 1 et LYON 2 (Directrice : Valérie BOTTA-GENOULAZ)

14. Ingénierie des Matériaux Polymères
(IMP) CNRS UMR 5223 avec LYON1 et Université de Saint-Etienne
(Directeur site INSA :  Etienne FLEURY)

15. Matériaux : Ingénierie et Science
(MATEIS) CNRS UMR 5510 avec LYON 1 (Directeur : Joël COURBON)

16. Laboratoire de Mécanique des Contacts et des Structures
(LaMCoS) CNRS UMR 5259 (Directeur : David DUREISSEIX)

17. Laboratoire de Mécanique des Fluides et d’Acoustique
(LMFA) CNRS UMR 5509 avec ECL et LYON1 (Responsable site INSA : Jean-Yves CHAMPAGNE)

18. Microbiologie, Adaptation et Pathogènie
(MAP) CNRS UMR 5240 avec LYON1 et Bayer CropScience (Directrice Nicole COTTE-PATTAT)

19. Cardiovasculaire, Métabolisme, Diabétologie et Nutrition
(CARMEN ) INSERM avec LYON1, HCL et INRA (Directrice du site INSA: Isabelle VANDENBROUCKE )

20. Laboratoire Vibrations et Acoustique
(LVA) EA 677 (Directeur : Etienne PARIZET) 

21. Unité Mixte Internationale (UMI) en Nanotechnologies et Nanosystèmes
(LN2) (Directeur  : Abdelkader SOUIFI - Directeur adjoint : Vincent AIMEZ)