Dans un grand nombre de filières, la formation des élèves se termine par un "Projet de Fin d'Études" (PFE), travail de recherche ou de recherche-développement, réalisé en individuel ou par très petits groupes sur 4 à 6 mois équivalent temps plein.

Les PFE se déroulent dans un laboratoire de l'INSA de Lyon ou en entreprise. Dans tous les cas, ils sont suivis et encadrés par des enseignants chercheurs de l'INSA de Lyon et donnent lieu à rapport et soutenance.